Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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