Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
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