Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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