Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms