Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.2 ms