Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms