Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABPAQ06546 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms