Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms