Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN1Q04323 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms