Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms