Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms