Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BEX3Q00994 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BEX3Q00994 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BEX3Q00994 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BEX3Q00994 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BEX3Q00994 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BEX3Q00994 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BEX3Q00994 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BEX3Q00994 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BEX3Q00994 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BEX3Q00994 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BEX3Q00994 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BEX3Q00994 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BEX3Q00994 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BEX3Q00994 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BEX3Q00994 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BEX3Q00994 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BEX3Q00994 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BEX3Q00994 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BEX3Q00994 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BEX3Q00994 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BEX3Q00994 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BEX3Q00994 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BEX3Q00994 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BEX3Q00994 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BEX3Q00994 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BEX3Q00994 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BEX3Q00994 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BEX3Q00994 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BEX3Q00994 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BEX3Q00994 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BEX3Q00994 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BEX3Q00994 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BEX3Q00994 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BEX3Q00994 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BEX3Q00994 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BEX3Q00994 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BEX3Q00994 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BEX3Q00994 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BEX3Q00994 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BEX3Q00994 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BEX3Q00994 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BEX3Q00994 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BEX3Q00994 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BEX3Q00994 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BEX3Q00994 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms