Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms