Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD3P84022 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD3P84022 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD3P84022 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD3P84022 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD3P84022 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD3P84022 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD3P84022 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD3P84022 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD3P84022 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD3P84022 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD3P84022 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD3P84022 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD3P84022 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD3P84022 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD3P84022 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD3P84022 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD3P84022 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD3P84022 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD3P84022 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD3P84022 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms