Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELF3P78545 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELF3P78545 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELF3P78545 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELF3P78545 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELF3P78545 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELF3P78545 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ELF3P78545 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ELF3P78545 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ELF3P78545 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELF3P78545 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELF3P78545 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ELF3P78545 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELF3P78545 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELF3P78545 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELF3P78545 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELF3P78545 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELF3P78545 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELF3P78545 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELF3P78545 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELF3P78545 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELF3P78545 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELF3P78545 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELF3P78545 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELF3P78545 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELF3P78545 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ELF3P78545 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ELF3P78545 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELF3P78545 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELF3P78545 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELF3P78545 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ELF3P78545 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELF3P78545 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELF3P78545 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ELF3P78545 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELF3P78545 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELF3P78545 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELF3P78545 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELF3P78545 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELF3P78545 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELF3P78545 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELF3P78545 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELF3P78545 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELF3P78545 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELF3P78545 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELF3P78545 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELF3P78545 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELF3P78545 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELF3P78545 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELF3P78545 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELF3P78545 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELF3P78545 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELF3P78545 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELF3P78545 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELF3P78545 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELF3P78545 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELF3P78545 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELF3P78545 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELF3P78545 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELF3P78545 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELF3P78545 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELF3P78545 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELF3P78545 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELF3P78545 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELF3P78545 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELF3P78545 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELF3P78545 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELF3P78545 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELF3P78545 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELF3P78545 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELF3P78545 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELF3P78545 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELF3P78545 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELF3P78545 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELF3P78545 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELF3P78545 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELF3P78545 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELF3P78545 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ELF3P78545 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELF3P78545 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELF3P78545 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELF3P78545 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELF3P78545 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELF3P78545 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELF3P78545 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELF3P78545 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELF3P78545 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELF3P78545 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELF3P78545 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELF3P78545 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELF3P78545 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELF3P78545 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELF3P78545 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELF3P78545 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELF3P78545 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELF3P78545 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELF3P78545 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELF3P78545 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELF3P78545 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELF3P78545 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms