Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms