Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP1P63208 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP1P63208 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP1P63208 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP1P63208 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP1P63208 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP1P63208 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP1P63208 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP1P63208 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP1P63208 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP1P63208 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP1P63208 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP1P63208 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP1P63208 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP1P63208 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP1P63208 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP1P63208 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP1P63208 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP1P63208 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP1P63208 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP1P63208 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP1P63208 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP1P63208 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP1P63208 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP1P63208 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP1P63208 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP1P63208 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP1P63208 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP1P63208 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP1P63208 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP1P63208 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP1P63208 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP1P63208 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP1P63208 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP1P63208 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP1P63208 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP1P63208 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP1P63208 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP1P63208 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP1P63208 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP1P63208 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP1P63208 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP1P63208 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP1P63208 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP1P63208 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP1P63208 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP1P63208 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP1P63208 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP1P63208 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP1P63208 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP1P63208 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP1P63208 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP1P63208 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP1P63208 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP1P63208 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP1P63208 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP1P63208 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP1P63208 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP1P63208 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP1P63208 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP1P63208 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP1P63208 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP1P63208 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP1P63208 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP1P63208 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP1P63208 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP1P63208 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP1P63208 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP1P63208 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP1P63208 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP1P63208 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP1P63208 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP1P63208 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP1P63208 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP1P63208 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP1P63208 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP1P63208 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP1P63208 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP1P63208 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP1P63208 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP1P63208 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP1P63208 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP1P63208 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP1P63208 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP1P63208 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP1P63208 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP1P63208 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP1P63208 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP1P63208 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP1P63208 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP1P63208 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP1P63208 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SKP1P63208 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SKP1P63208 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SKP1P63208 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SKP1P63208 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SKP1P63208 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SKP1P63208 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SKP1P63208 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SKP1P63208 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms