Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
UFM1P61960 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
UFM1P61960 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFM1P61960 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFM1P61960 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
UFM1P61960 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFM1P61960 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFM1P61960 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFM1P61960 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFM1P61960 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFM1P61960 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFM1P61960 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFM1P61960 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFM1P61960 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFM1P61960 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFM1P61960 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFM1P61960 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFM1P61960 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFM1P61960 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFM1P61960 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFM1P61960 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFM1P61960 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFM1P61960 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFM1P61960 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFM1P61960 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFM1P61960 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFM1P61960 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFM1P61960 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFM1P61960 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFM1P61960 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
UFM1P61960 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFM1P61960 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFM1P61960 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
UFM1P61960 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFM1P61960 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFM1P61960 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFM1P61960 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFM1P61960 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFM1P61960 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFM1P61960 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFM1P61960 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFM1P61960 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFM1P61960 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFM1P61960 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFM1P61960 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UFM1P61960 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UFM1P61960 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UFM1P61960 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UFM1P61960 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UFM1P61960 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
UFM1P61960 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UFM1P61960 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UFM1P61960 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UFM1P61960 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UFM1P61960 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UFM1P61960 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UFM1P61960 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UFM1P61960 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
UFM1P61960 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UFM1P61960 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UFM1P61960 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UFM1P61960 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UFM1P61960 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
UFM1P61960 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UFM1P61960 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
UFM1P61960 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UFM1P61960 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UFM1P61960 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UFM1P61960 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UFM1P61960 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UFM1P61960 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UFM1P61960 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UFM1P61960 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UFM1P61960 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFM1P61960 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFM1P61960 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFM1P61960 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFM1P61960 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFM1P61960 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFM1P61960 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFM1P61960 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFM1P61960 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFM1P61960 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFM1P61960 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFM1P61960 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFM1P61960 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFM1P61960 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFM1P61960 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UFM1P61960 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFM1P61960 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFM1P61960 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFM1P61960 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFM1P61960 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFM1P61960 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFM1P61960 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UFM1P61960 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFM1P61960 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UFM1P61960 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFM1P61960 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFM1P61960 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms