Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms