Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms