Protein–RNA interactions for Protein: P57729

RAB38, Ras-related protein Rab-38, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB38P57729 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB38P57729 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB38P57729 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB38P57729 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB38P57729 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB38P57729 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB38P57729 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB38P57729 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB38P57729 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB38P57729 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB38P57729 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB38P57729 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB38P57729 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB38P57729 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB38P57729 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB38P57729 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB38P57729 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB38P57729 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB38P57729 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB38P57729 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB38P57729 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB38P57729 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB38P57729 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB38P57729 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB38P57729 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB38P57729 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB38P57729 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB38P57729 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB38P57729 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB38P57729 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB38P57729 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB38P57729 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB38P57729 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB38P57729 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB38P57729 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB38P57729 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB38P57729 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB38P57729 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB38P57729 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB38P57729 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB38P57729 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB38P57729 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB38P57729 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB38P57729 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB38P57729 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB38P57729 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB38P57729 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB38P57729 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB38P57729 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB38P57729 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB38P57729 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB38P57729 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB38P57729 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB38P57729 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB38P57729 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB38P57729 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB38P57729 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB38P57729 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB38P57729 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB38P57729 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB38P57729 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB38P57729 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB38P57729 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB38P57729 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB38P57729 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB38P57729 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB38P57729 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB38P57729 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB38P57729 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB38P57729 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB38P57729 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB38P57729 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB38P57729 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB38P57729 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB38P57729 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB38P57729 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB38P57729 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB38P57729 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB38P57729 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB38P57729 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB38P57729 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB38P57729 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB38P57729 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB38P57729 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB38P57729 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB38P57729 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB38P57729 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB38P57729 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB38P57729 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB38P57729 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB38P57729 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB38P57729 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB38P57729 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB38P57729 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB38P57729 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB38P57729 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB38P57729 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB38P57729 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB38P57729 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB38P57729 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms