Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME5P56597 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME5P56597 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME5P56597 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME5P56597 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME5P56597 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME5P56597 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME5P56597 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME5P56597 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME5P56597 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME5P56597 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME5P56597 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME5P56597 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NME5P56597 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NME5P56597 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME5P56597 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME5P56597 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NME5P56597 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NME5P56597 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NME5P56597 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME5P56597 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME5P56597 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME5P56597 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME5P56597 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME5P56597 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME5P56597 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME5P56597 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME5P56597 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME5P56597 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME5P56597 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME5P56597 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME5P56597 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NME5P56597 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME5P56597 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME5P56597 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME5P56597 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME5P56597 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME5P56597 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME5P56597 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME5P56597 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME5P56597 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME5P56597 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME5P56597 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME5P56597 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME5P56597 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME5P56597 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME5P56597 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME5P56597 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME5P56597 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME5P56597 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME5P56597 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME5P56597 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME5P56597 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME5P56597 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME5P56597 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NME5P56597 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NME5P56597 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME5P56597 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME5P56597 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME5P56597 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME5P56597 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME5P56597 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME5P56597 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME5P56597 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME5P56597 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NME5P56597 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME5P56597 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME5P56597 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME5P56597 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME5P56597 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME5P56597 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME5P56597 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME5P56597 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME5P56597 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME5P56597 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME5P56597 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME5P56597 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME5P56597 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME5P56597 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME5P56597 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME5P56597 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME5P56597 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME5P56597 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME5P56597 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME5P56597 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME5P56597 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME5P56597 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME5P56597 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME5P56597 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME5P56597 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME5P56597 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME5P56597 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME5P56597 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME5P56597 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME5P56597 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME5P56597 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME5P56597 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NME5P56597 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME5P56597 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME5P56597 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms