Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms