Protein–RNA interactions for Protein: P55289

CDH12, Cadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH12P55289 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH12P55289 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDH12P55289 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDH12P55289 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDH12P55289 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDH12P55289 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDH12P55289 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDH12P55289 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDH12P55289 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDH12P55289 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDH12P55289 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDH12P55289 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDH12P55289 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH12P55289 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH12P55289 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH12P55289 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH12P55289 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH12P55289 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH12P55289 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH12P55289 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH12P55289 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH12P55289 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH12P55289 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH12P55289 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH12P55289 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH12P55289 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH12P55289 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH12P55289 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH12P55289 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH12P55289 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH12P55289 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH12P55289 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH12P55289 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH12P55289 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH12P55289 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH12P55289 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH12P55289 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH12P55289 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH12P55289 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH12P55289 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH12P55289 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH12P55289 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH12P55289 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH12P55289 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH12P55289 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH12P55289 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH12P55289 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH12P55289 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH12P55289 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH12P55289 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH12P55289 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH12P55289 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH12P55289 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH12P55289 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH12P55289 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH12P55289 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH12P55289 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH12P55289 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH12P55289 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH12P55289 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH12P55289 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH12P55289 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH12P55289 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH12P55289 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH12P55289 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH12P55289 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH12P55289 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH12P55289 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH12P55289 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH12P55289 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH12P55289 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH12P55289 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH12P55289 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH12P55289 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH12P55289 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH12P55289 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH12P55289 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH12P55289 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH12P55289 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH12P55289 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH12P55289 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH12P55289 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH12P55289 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH12P55289 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH12P55289 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH12P55289 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH12P55289 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH12P55289 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH12P55289 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH12P55289 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH12P55289 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH12P55289 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH12P55289 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH12P55289 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH12P55289 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH12P55289 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH12P55289 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH12P55289 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH12P55289 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH12P55289 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms