Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms