Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCR4P51679 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCR4P51679 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCR4P51679 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCR4P51679 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCR4P51679 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCR4P51679 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCR4P51679 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCR4P51679 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCR4P51679 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCR4P51679 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCR4P51679 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCR4P51679 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCR4P51679 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCR4P51679 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCR4P51679 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCR4P51679 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCR4P51679 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCR4P51679 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCR4P51679 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCR4P51679 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCR4P51679 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCR4P51679 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCR4P51679 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCR4P51679 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCR4P51679 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCR4P51679 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCR4P51679 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCR4P51679 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCR4P51679 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCR4P51679 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCR4P51679 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCR4P51679 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCR4P51679 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCR4P51679 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCR4P51679 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCR4P51679 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCR4P51679 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCR4P51679 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCR4P51679 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCR4P51679 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCR4P51679 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCR4P51679 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCR4P51679 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCR4P51679 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCR4P51679 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCR4P51679 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCR4P51679 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCR4P51679 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCR4P51679 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCR4P51679 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCR4P51679 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCR4P51679 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCR4P51679 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCR4P51679 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCR4P51679 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCR4P51679 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCR4P51679 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCR4P51679 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCR4P51679 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCR4P51679 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCR4P51679 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCR4P51679 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCR4P51679 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCR4P51679 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCR4P51679 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCR4P51679 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCR4P51679 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCR4P51679 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCR4P51679 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCR4P51679 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCR4P51679 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCR4P51679 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCR4P51679 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCR4P51679 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCR4P51679 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCR4P51679 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCR4P51679 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCR4P51679 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCR4P51679 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCR4P51679 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCR4P51679 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCR4P51679 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCR4P51679 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCR4P51679 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCR4P51679 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCR4P51679 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCR4P51679 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCR4P51679 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCR4P51679 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCR4P51679 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCR4P51679 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCR4P51679 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCR4P51679 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCR4P51679 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCR4P51679 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCR4P51679 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCR4P51679 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCR4P51679 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCR4P51679 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms