Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETV1P50549 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETV1P50549 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETV1P50549 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETV1P50549 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETV1P50549 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETV1P50549 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETV1P50549 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETV1P50549 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETV1P50549 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETV1P50549 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETV1P50549 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ETV1P50549 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ETV1P50549 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETV1P50549 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ETV1P50549 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETV1P50549 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ETV1P50549 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETV1P50549 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETV1P50549 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ETV1P50549 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETV1P50549 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETV1P50549 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETV1P50549 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETV1P50549 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETV1P50549 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETV1P50549 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETV1P50549 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETV1P50549 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETV1P50549 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETV1P50549 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETV1P50549 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETV1P50549 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETV1P50549 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETV1P50549 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETV1P50549 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV1P50549 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV1P50549 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms