Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA4P48169 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms