Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms