Protein–RNA interactions for Protein: P45985

MAP2K4, Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP2K4P45985 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MAP2K4P45985 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms