Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPD2P43304 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPD2P43304 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPD2P43304 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPD2P43304 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPD2P43304 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPD2P43304 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPD2P43304 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPD2P43304 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GPD2P43304 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPD2P43304 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPD2P43304 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GPD2P43304 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPD2P43304 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPD2P43304 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPD2P43304 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPD2P43304 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPD2P43304 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPD2P43304 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPD2P43304 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPD2P43304 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPD2P43304 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPD2P43304 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPD2P43304 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPD2P43304 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPD2P43304 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPD2P43304 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPD2P43304 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPD2P43304 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPD2P43304 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPD2P43304 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPD2P43304 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPD2P43304 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPD2P43304 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPD2P43304 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPD2P43304 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPD2P43304 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPD2P43304 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPD2P43304 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPD2P43304 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPD2P43304 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPD2P43304 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPD2P43304 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPD2P43304 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPD2P43304 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPD2P43304 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPD2P43304 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPD2P43304 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GPD2P43304 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPD2P43304 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GPD2P43304 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPD2P43304 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPD2P43304 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPD2P43304 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPD2P43304 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPD2P43304 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPD2P43304 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPD2P43304 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPD2P43304 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPD2P43304 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPD2P43304 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPD2P43304 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPD2P43304 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPD2P43304 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPD2P43304 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPD2P43304 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPD2P43304 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPD2P43304 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPD2P43304 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPD2P43304 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPD2P43304 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPD2P43304 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPD2P43304 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPD2P43304 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPD2P43304 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPD2P43304 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPD2P43304 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPD2P43304 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPD2P43304 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPD2P43304 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GPD2P43304 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPD2P43304 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPD2P43304 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPD2P43304 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GPD2P43304 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPD2P43304 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPD2P43304 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPD2P43304 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPD2P43304 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPD2P43304 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPD2P43304 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPD2P43304 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPD2P43304 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPD2P43304 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPD2P43304 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPD2P43304 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPD2P43304 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPD2P43304 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPD2P43304 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPD2P43304 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms