Protein–RNA interactions for Protein: P42771

CDKN2A, Cyclin-dependent kinase inhibitor 2A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2AP42771 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN2AP42771 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms