Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPARGP37231 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPARGP37231 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPARGP37231 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPARGP37231 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPARGP37231 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPARGP37231 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPARGP37231 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPARGP37231 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPARGP37231 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPARGP37231 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPARGP37231 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PPARGP37231 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPARGP37231 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPARGP37231 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPARGP37231 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPARGP37231 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPARGP37231 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPARGP37231 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPARGP37231 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPARGP37231 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPARGP37231 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPARGP37231 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPARGP37231 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPARGP37231 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPARGP37231 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPARGP37231 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPARGP37231 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPARGP37231 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPARGP37231 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PPARGP37231 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPARGP37231 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPARGP37231 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PPARGP37231 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPARGP37231 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPARGP37231 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPARGP37231 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPARGP37231 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPARGP37231 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPARGP37231 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPARGP37231 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPARGP37231 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPARGP37231 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPARGP37231 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPARGP37231 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPARGP37231 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPARGP37231 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPARGP37231 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PPARGP37231 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPARGP37231 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPARGP37231 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPARGP37231 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPARGP37231 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPARGP37231 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PPARGP37231 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPARGP37231 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPARGP37231 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPARGP37231 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPARGP37231 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPARGP37231 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPARGP37231 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPARGP37231 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPARGP37231 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPARGP37231 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PPARGP37231 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPARGP37231 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPARGP37231 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPARGP37231 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPARGP37231 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPARGP37231 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPARGP37231 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPARGP37231 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPARGP37231 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPARGP37231 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPARGP37231 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPARGP37231 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPARGP37231 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPARGP37231 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPARGP37231 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PPARGP37231 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPARGP37231 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPARGP37231 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPARGP37231 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPARGP37231 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPARGP37231 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PPARGP37231 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPARGP37231 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPARGP37231 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPARGP37231 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPARGP37231 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPARGP37231 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPARGP37231 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPARGP37231 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPARGP37231 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPARGP37231 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPARGP37231 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPARGP37231 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPARGP37231 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPARGP37231 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPARGP37231 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms