Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTX2P32243 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTX2P32243 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTX2P32243 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTX2P32243 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTX2P32243 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTX2P32243 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTX2P32243 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTX2P32243 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTX2P32243 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTX2P32243 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTX2P32243 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
OTX2P32243 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTX2P32243 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTX2P32243 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTX2P32243 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTX2P32243 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTX2P32243 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTX2P32243 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTX2P32243 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTX2P32243 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTX2P32243 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTX2P32243 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
OTX2P32243 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTX2P32243 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTX2P32243 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTX2P32243 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTX2P32243 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTX2P32243 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTX2P32243 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTX2P32243 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTX2P32243 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTX2P32243 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTX2P32243 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTX2P32243 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTX2P32243 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTX2P32243 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16■□□□□ 0.15
OTX2P32243 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTX2P32243 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OTX2P32243 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTX2P32243 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16■□□□□ 0.15
OTX2P32243 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16■□□□□ 0.15
OTX2P32243 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTX2P32243 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTX2P32243 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTX2P32243 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTX2P32243 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTX2P32243 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTX2P32243 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTX2P32243 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
OTX2P32243 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTX2P32243 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
OTX2P32243 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
OTX2P32243 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTX2P32243 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16■□□□□ 0.15
OTX2P32243 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
OTX2P32243 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16■□□□□ 0.15
OTX2P32243 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OTX2P32243 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
OTX2P32243 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OTX2P32243 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTX2P32243 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OTX2P32243 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
OTX2P32243 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OTX2P32243 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTX2P32243 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OTX2P32243 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
OTX2P32243 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTX2P32243 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTX2P32243 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OTX2P32243 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTX2P32243 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OTX2P32243 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTX2P32243 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTX2P32243 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OTX2P32243 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTX2P32243 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTX2P32243 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTX2P32243 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTX2P32243 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTX2P32243 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTX2P32243 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTX2P32243 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTX2P32243 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTX2P32243 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTX2P32243 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTX2P32243 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTX2P32243 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTX2P32243 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTX2P32243 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTX2P32243 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTX2P32243 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTX2P32243 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTX2P32243 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTX2P32243 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTX2P32243 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTX2P32243 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTX2P32243 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTX2P32243 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
OTX2P32243 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms