Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms