Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC27P30260 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC27P30260 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC27P30260 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC27P30260 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC27P30260 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC27P30260 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC27P30260 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC27P30260 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC27P30260 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC27P30260 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC27P30260 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC27P30260 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC27P30260 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC27P30260 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC27P30260 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC27P30260 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC27P30260 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC27P30260 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC27P30260 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC27P30260 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC27P30260 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC27P30260 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC27P30260 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC27P30260 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC27P30260 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC27P30260 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC27P30260 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC27P30260 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC27P30260 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC27P30260 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC27P30260 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC27P30260 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC27P30260 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC27P30260 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC27P30260 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC27P30260 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC27P30260 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC27P30260 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC27P30260 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC27P30260 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC27P30260 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC27P30260 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC27P30260 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC27P30260 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC27P30260 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC27P30260 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC27P30260 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC27P30260 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC27P30260 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC27P30260 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC27P30260 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC27P30260 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC27P30260 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC27P30260 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC27P30260 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC27P30260 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC27P30260 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC27P30260 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC27P30260 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC27P30260 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC27P30260 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC27P30260 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC27P30260 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC27P30260 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC27P30260 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC27P30260 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC27P30260 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC27P30260 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC27P30260 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC27P30260 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC27P30260 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC27P30260 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC27P30260 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC27P30260 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC27P30260 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC27P30260 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC27P30260 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC27P30260 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC27P30260 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC27P30260 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC27P30260 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC27P30260 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC27P30260 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC27P30260 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC27P30260 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC27P30260 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC27P30260 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC27P30260 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC27P30260 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC27P30260 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC27P30260 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC27P30260 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC27P30260 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC27P30260 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC27P30260 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC27P30260 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC27P30260 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC27P30260 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC27P30260 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms