Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5AP29375 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KDM5AP29375 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KDM5AP29375 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KDM5AP29375 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KDM5AP29375 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KDM5AP29375 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5AP29375 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5AP29375 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5AP29375 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5AP29375 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5AP29375 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5AP29375 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5AP29375 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms