Protein–RNA interactions for Protein: P28838

LAP3, Cytosol aminopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAP3P28838 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAP3P28838 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAP3P28838 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAP3P28838 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAP3P28838 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAP3P28838 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAP3P28838 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAP3P28838 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAP3P28838 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAP3P28838 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAP3P28838 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAP3P28838 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAP3P28838 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAP3P28838 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAP3P28838 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAP3P28838 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAP3P28838 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAP3P28838 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAP3P28838 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAP3P28838 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAP3P28838 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAP3P28838 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAP3P28838 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAP3P28838 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAP3P28838 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAP3P28838 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAP3P28838 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAP3P28838 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAP3P28838 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAP3P28838 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LAP3P28838 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAP3P28838 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAP3P28838 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAP3P28838 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAP3P28838 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAP3P28838 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAP3P28838 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAP3P28838 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAP3P28838 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAP3P28838 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAP3P28838 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAP3P28838 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAP3P28838 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms