Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMO2P25791 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMO2P25791 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMO2P25791 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMO2P25791 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMO2P25791 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMO2P25791 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMO2P25791 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMO2P25791 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMO2P25791 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMO2P25791 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LMO2P25791 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMO2P25791 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMO2P25791 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMO2P25791 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMO2P25791 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMO2P25791 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMO2P25791 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMO2P25791 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMO2P25791 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMO2P25791 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMO2P25791 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMO2P25791 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMO2P25791 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMO2P25791 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMO2P25791 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMO2P25791 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMO2P25791 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMO2P25791 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMO2P25791 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMO2P25791 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMO2P25791 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMO2P25791 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMO2P25791 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LMO2P25791 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMO2P25791 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMO2P25791 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMO2P25791 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMO2P25791 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMO2P25791 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMO2P25791 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMO2P25791 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMO2P25791 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMO2P25791 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMO2P25791 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMO2P25791 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMO2P25791 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMO2P25791 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMO2P25791 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMO2P25791 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMO2P25791 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMO2P25791 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMO2P25791 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMO2P25791 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMO2P25791 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMO2P25791 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LMO2P25791 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LMO2P25791 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMO2P25791 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMO2P25791 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMO2P25791 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMO2P25791 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMO2P25791 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMO2P25791 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMO2P25791 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMO2P25791 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMO2P25791 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMO2P25791 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMO2P25791 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMO2P25791 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMO2P25791 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMO2P25791 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMO2P25791 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMO2P25791 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMO2P25791 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMO2P25791 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMO2P25791 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMO2P25791 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LMO2P25791 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LMO2P25791 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMO2P25791 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMO2P25791 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMO2P25791 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMO2P25791 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMO2P25791 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO2P25791 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO2P25791 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO2P25791 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO2P25791 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO2P25791 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO2P25791 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO2P25791 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO2P25791 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO2P25791 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO2P25791 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO2P25791 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO2P25791 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO2P25791 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO2P25791 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LMO2P25791 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms