Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA1P25786 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms