Protein–RNA interactions for Protein: P25705

ATP5A1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1P25705 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5A1P25705 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms