Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms