Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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