Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms