Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHCEP18577 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHCEP18577 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHCEP18577 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
RHCEP18577 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHCEP18577 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHCEP18577 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RHCEP18577 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RHCEP18577 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHCEP18577 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHCEP18577 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHCEP18577 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHCEP18577 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHCEP18577 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHCEP18577 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHCEP18577 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHCEP18577 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHCEP18577 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHCEP18577 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHCEP18577 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHCEP18577 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHCEP18577 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHCEP18577 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RHCEP18577 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHCEP18577 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHCEP18577 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHCEP18577 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHCEP18577 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHCEP18577 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHCEP18577 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHCEP18577 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHCEP18577 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHCEP18577 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHCEP18577 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHCEP18577 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHCEP18577 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHCEP18577 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHCEP18577 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHCEP18577 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHCEP18577 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHCEP18577 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RHCEP18577 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RHCEP18577 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHCEP18577 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHCEP18577 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHCEP18577 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHCEP18577 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHCEP18577 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHCEP18577 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHCEP18577 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHCEP18577 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHCEP18577 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHCEP18577 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHCEP18577 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHCEP18577 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHCEP18577 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHCEP18577 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHCEP18577 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHCEP18577 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHCEP18577 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHCEP18577 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHCEP18577 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHCEP18577 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHCEP18577 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHCEP18577 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHCEP18577 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHCEP18577 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RHCEP18577 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHCEP18577 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHCEP18577 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RHCEP18577 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHCEP18577 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHCEP18577 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHCEP18577 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHCEP18577 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHCEP18577 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHCEP18577 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHCEP18577 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHCEP18577 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHCEP18577 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHCEP18577 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHCEP18577 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHCEP18577 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHCEP18577 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHCEP18577 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHCEP18577 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHCEP18577 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHCEP18577 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHCEP18577 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHCEP18577 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHCEP18577 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHCEP18577 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RHCEP18577 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHCEP18577 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHCEP18577 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHCEP18577 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHCEP18577 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHCEP18577 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHCEP18577 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHCEP18577 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms