Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms