Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BMP4P12644 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BMP4P12644 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BMP4P12644 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BMP4P12644 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BMP4P12644 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BMP4P12644 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BMP4P12644 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BMP4P12644 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BMP4P12644 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BMP4P12644 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BMP4P12644 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BMP4P12644 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BMP4P12644 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BMP4P12644 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BMP4P12644 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BMP4P12644 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BMP4P12644 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BMP4P12644 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BMP4P12644 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BMP4P12644 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BMP4P12644 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BMP4P12644 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BMP4P12644 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BMP4P12644 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BMP4P12644 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BMP4P12644 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BMP4P12644 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BMP4P12644 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BMP4P12644 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BMP4P12644 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BMP4P12644 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BMP4P12644 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BMP4P12644 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BMP4P12644 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BMP4P12644 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BMP4P12644 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BMP4P12644 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BMP4P12644 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BMP4P12644 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BMP4P12644 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BMP4P12644 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BMP4P12644 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BMP4P12644 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BMP4P12644 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BMP4P12644 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BMP4P12644 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMP4P12644 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMP4P12644 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMP4P12644 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMP4P12644 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMP4P12644 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMP4P12644 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BMP4P12644 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMP4P12644 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMP4P12644 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMP4P12644 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMP4P12644 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMP4P12644 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMP4P12644 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMP4P12644 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMP4P12644 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMP4P12644 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMP4P12644 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMP4P12644 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMP4P12644 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMP4P12644 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BMP4P12644 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMP4P12644 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMP4P12644 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMP4P12644 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BMP4P12644 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMP4P12644 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMP4P12644 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMP4P12644 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMP4P12644 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMP4P12644 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMP4P12644 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMP4P12644 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMP4P12644 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMP4P12644 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMP4P12644 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMP4P12644 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMP4P12644 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMP4P12644 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMP4P12644 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMP4P12644 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMP4P12644 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMP4P12644 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMP4P12644 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMP4P12644 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMP4P12644 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
BMP4P12644 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BMP4P12644 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BMP4P12644 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BMP4P12644 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BMP4P12644 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BMP4P12644 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BMP4P12644 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
BMP4P12644 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms