Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A1P11836 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms