Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C8orf88P0DMB2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms