Protein–RNA interactions for Protein: P0C5Y4

KRTAP1-4, Keratin-associated protein 1-4, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-4P0C5Y4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-4P0C5Y4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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